BLASTN 2.2.18 Mar-02-2008
Reference: Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,  Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),  "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Contig128
         (2358 letters)
Database: /home/vicky/BKPVICKY/BLASTdb/tabaco.fasta
         1 sequences; 430597 total letters
Searching................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value
gi|57013877|ref|NC_006581.1| Nicotiana tabacum mitochondrion ... 4363.6    0.0

>ref|NC_006581.1| Nicotiana tabacum mitochondrion, complete genome 

 Length = 430597


Score = 4363.65 bits (2201.0), Expect = 0.0
Identities = 2293/2322 (99%)
Strand = Plus/Minus

Query: 2317   TTTGCTAGCTTGCATGACGGGCTGTAAGACGCTCAATCAATCGGGCGCTATCCCACCCTT 2258
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 344895 TTTGCTAGCTTGCATGACGGGCTGTAAGACGCTCAATCAATCGGGCGCTATCCCACCCTT 344954

Query: 2257   TCTTCCTTGATCTACACATTCACGCCCTTTAGAGTTAAGGAATGATGGTTAAGAGTTCTT 2198
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 344955 -CTTCCTTGATCTACACATTCACGCCCTTTAGAGTTAAGGAATGATGGTTAAGAGTTCTT 345013

Query: 2197   GCTTTTGAGTTCCCACTCTGACTATTTAGAAGGCTATATAGAATAATACCTTAATGAATT 2138
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||
Sbjct: 345014 ACTTTTGAGTTCCCACTCTGACTATTTAGAAGGCTATA----ATAATACCTTAATTAATT 345069

Query: 2137   GAAGCGGATAAAGCTCAGCATTTCTCTAATTTGAATCGAAAGTTGCTTTTGACTCCTCCG 2078
                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 345070 TTTTCGGATAAAGCTCAGCATTTCTCTAATTTGAATCGAAAGTTGCTTTTTACTCCTCCG 345129

Query: 2077   CCTTTGAAGGCTGGTTACATCCAATGTCTCCTACGAGGCTGCCTTAAAGTCCTCTTTGTC 2018
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 345130 CCTTTGAAGGCTGGTTACATCCAATGTCTCCTACGAGGCTGTCTTAAAGTCCTCTTTGTC 345189

Query: 2017   TAGGCAGAGGTATAGCCCTTTTTGAATACATTTGACTTGGTGCTCACTTGTAGGAAGATT 1958
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 345190 TAGGCAGAGGTATAGCCCTTTTTGAATACATTTGACTTGGTGCTCACTTGTAGGAAGATT 345249

Query: 1957   CCCCGCTCTGAAGTCAAGTCTTTTTTGGAGCTCCTTCCAAAGAGGTTGGGATTAGACTTT 1898
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 345250 CCCCGCTCTGAAGTCAAGTCTTTTTTGGAGCTCCTTCCAAAGAGGTTGGGATTAGACTTT 345309

Query: 1897   CAATTGGATGTGTCCCGGTCAAATCGTTAACGACAGATCCCTGCAGACGTACTACTTTCA 1838
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 345310 CAATTGGATGTGTCCCGGTCAAATCGTTAACGACAGATCCCTGCAGACGTACTACTTTCA 345369

Query: 1837   ATCAAACCTTCTCTCCTTTACCTTCTTGATTGATAGATAGTGAGGCCTAGGACTTGCTTC 1778
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 345370 ATCAAACCTTCTCTCCTTTACCTTCTTGATTGATAGATAGTGAGGCCTAGGACTTGCTTC 345429

Query: 1777   CTTAGATTTGTTGAATTTACTCTGTCTTCACGAATTGGATTTGAACAAATATCTCTGGGC 1718
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 345430 CTTAGATTTGTTGAATTTACTCTGTCTTCACGAATTGGATTTGAACAAATATCTCTGGGC 345489

Query: 1717   GACTTTCCTTTTAATCGATCGTGAGGGGGGTTTCCACTTTATTACTCAGGTAGAGTGAAA 1658
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 345490 GACTTTCCTTTTAATCGATCGTGAGGGGGGTTTCCACTTTATTACTCGGGTAGAGTGAAA 345549

Query: 1657   TGGCTAGGCTCCCCTATCACCTTTCCTTTCGGTGATATATTTTGCCTTAGCACTTACGAA 1598
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 345550 TGGCTAGGCTCCCCTATCACCTTTCCTTTCGGTGATATATTTTGCCTTAGCACTTACGAA 345609

Query: 1597   GTAGACGTCATTTATTGAGTTGAAGTGAAGTCTTTCCGTTCCCGATTCAATTACAGCTGT 1538
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 345610 GTAGACGTCATTTATTGAGTTGAAGTGAAGTCTTTCCGTTCCCGATTCAATTACAGCTGT 345669

Query: 1537   TCTCGCTAAAGCCCGATCTGATCCCGCTTGAGCGGCAGGGAGAAATCCTGATCTTCCAAT 1478
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 345670 TCTCGCTAAAGCCCGATCTGATCCCGCTTGAGCGGCAGGGAGAAATCCTGATCTTCCAAT 345729

Query: 1477   TGCGTCAATACAATAAGATAGATGCCTGAATCGCTCCGTGGCTTTATACACCCCAAAAAA 1418
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 345730 TGCGTCAATACAATAAGATAGATGCCTGAATCGCTCCGTGGCTTTATACACCCCAAAAAA 345789

Query: 1417   GAATGAATAGGC-----GCCCAGATGGAAAAATTACGATAGAAATAAAGCTTGGAAATGA 1363
              ||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 345790 GAATGAATAGGCGAGGCGCCCAGATGGAAAAATTACGATAGAAATAAAGCTTGGAAATGA 345849

Query: 1362   AGGATGCGCTCGCGGAAACAATGAGATCATCAACATAAACTATAAGATAGACTTGAATGC 1303
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 345850 AGGATGCGCTCGCGGAAACAATGAGATCATCAACATAAACTATAAGATAGACTTGAATGC 345909

Query: 1302   CTGTCAATCGGTATTCTATATGATGTGATGTTGCTAGTTTCATCTGCTAGTAAGAGAAGC 1243
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 345910 CTGTCAATCGGTATTCTATATGATGTGATGTTGCTAGTTTCATCTGCTAGTAAGAGAAGC 345969

Query: 1242   TGCGGTGAATGAATCCTTCTTAGCTAAGGAATGTTTGTTGGACACCCACCCATTGTCCAG 1183
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 345970 TGCGGTGAATGAATCCTTCTTAGCTAAGGAATGTTTGTTGGACACCCACCCATTGTCCAG 346029

Query: 1182   TTCCGGCTAGCGCTCCTCGTTGCCTTTGTTTGCACGGTCTCATCACTTAGTGGTCTGGCA 1123
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 346030 TTCCGGCTAGCGCTCCTCGTTGCCTTTGTTTGCACGGTCTCATCACTTAGTGGTCTGGCA 346089

Query: 1122   TGCAGTTAAACAGGTTGACCCTGGAAACCGCTTTCTTAAGTATGCTGTACTAGGGGACAA 1063
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 346090 TGCAGTTAAACAGGTTGACCCTGGAAACCGCTTTCTTAAGTATGCTGTACTAGGGGACAA 346149

Query: 1062   TGTAGGAGGACGCTCGTGTATATGAAAAAATTTTTTGTAATTGGGCTTTTTCTTTCCTAT 1003
              ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 346150 TGTAGGAGGACGCTCGTGTATATGAAAGAATTTTGGGTAATTGGGCTTTTTCTTTCCTAT 346209

Query: 1002   CAGAAATCTATGATTTCCCATCAAGGTTCAGCTGTGAATTCGCAAAGAGGTTCAGGGTTC 943
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 346210 CAGAAATCTATGATTTCCCATCAAGGTTCAGCTGTGAATTCGCAAAGAGGTTCAGGGTTC 346269

Query: 942    GTAATTTGAGTAAGGATCTTTCACCTATCTAAATTCGGGCTCTTATGAACTCTCACCATC 883
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 346270 GTAATTTGAGTAAGGATCTTTCACCTATCTAAATTCGGGCTCTTATGAACTCTCACCATC 346329

Query: 882    CCTATGGTACTATGGCTGTACAGCTACAGTACCCTATGAAGAGATTTTCCACTCTTTGTT 823
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 346330 CCTATGGTACTATGGCTGTACAGCTACAGTACCCTATGAAGAGATTTTCCACTCTTTGTT 346389

Query: 822    TTGTAGAGTAGGGGGTTGTGGGTTACCGTGCTCTATCTAGAATCGACCATGTTAGAAGTC 763
              |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 346390 TTGTAGAGTAGGGGGTTGGGGGTTACCGTGCTCTATCTAGAATCGACCATGTTAGAAGTC 346449

Query: 762    TTAAGGTAGAGAGGTTGATTGTGCTTCATGTCTCCCAAGAGCATATTGTTCTGAGTGAGG 703
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 346450 TTAAGGTAGAGAGGTTGATTGTGCTTCATGTCTCCCAAGAGCATATTGTTCTGAGTGAGG 346509

Query: 702    GTAATGTTTGCTATCGCCGCTTCCTGTTTTGCTTTCTTAGCGAAATGCGTGCTTCCGTTC 643
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 346510 GTAATGTTTGCTATCGCCGCTTCCTGTTTTGCTTTCTTAGCGAAATGCTTGCTTCCGTTC 346569

Query: 642    ACATCAAACATCGTTCTTTTCCCTTTTGCCCCTACCTTGGTGTTGACCCTAGGTTCGCTA 583
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 346570 ACATCAAACATCGTTCTTTTCCCTTTTGCCCCTACCTTGGTGTTGACCCTAGGTTCGCTA 346629

Query: 582    GCTTCCTTTCCGGTCTCGTATGGGGAGTAAGTTAAGCCATTCCACTAAAATACTCTTTAT 523
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 346630 GCTTCCTTTCCGGTCTCGTATGGGGAGTAAGTTAAGCCATTCCACTAAAATACTCTTTAT 346689

Query: 522    TGATTGAGCTTTCTCAGTCTTGGTTTGAAAGCCTTGACAGTTCAGTTCGCGTAGTTCGTA 463
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 346690 TGATTGAGCTTTCTCAGTCTTGGTTTGAAAGCCTTGACAGTTCAGTTCGCGTAGTTCGTA 346749

Query: 462    GCCATCGTTAGAGGAAAGAACTTGTATTACAAGGATTCATTAACTGTAAATCTGGCAATT 403
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||
Sbjct: 346750 GCCATCGTTAGAGGAAAGAACTTGTATTACAAGGATTCAGAAACTGTAAATCTGGCAATT 346809

Query: 402    CCTACCAGGGTGGTGGGTCAGAGCGGATTCCCTTGCTTTAGGGCAGGAATAGCGGAATGG 343
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 346810 CCTACCAGGGTGGTGGGTCAGAGCGGATTCCCTTGCTTTAGGGCAGGAATAGCGGAATGG 346869

Query: 342    TTGGGGGGCTTGTCTTTAAGCAGCTGGCTTCCACGTAGCTACAGCTGCAGAGGATAGTCT 283
              || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 346870 TTAGGGGGCCTGTCTTTAAGCAGCTGGCTTCCACGTAGCTACAGCTGCAGAGGATAGTCT 346929

Query: 282    CTAAAAGCTACAACCGTCTCTTCTTATTATTCTCCGAAAACATACCTAGGTTTTGGCAAT 223
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 346930 CTAAAAGCTACAACCGTCTCTTCTTATTATTCTCCGAAAACATACCTAGGTTTTGGCAAT 346989

Query: 222    CACTCTACTGACAGAGAACCTAAGAGCTACCAATAAGCCTTTAGGCAGGCAGCGGAAATG 163
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 346990 CACTCTACTGACAGAGAACCTAAGAGCTACCAATAAGCCTTTAGGCAGGCAGCGGAAATG 347049

Query: 162    GTAAATGTCGTCTTCCTTTACAATGACTTCTTCCTTTCCTCTTCACCATACGCAATTCTA 103
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 347050 GTAAATGTCGTCTTCCTTTACAATGACTTCTTCCTTTCCTCTTCACCATACGCAATTCTA 347109

Query: 102    GCTCACCCTCGGATCAGGGGATACCTTAAGTCAGCAGCTCCCTTTGAAGATAGGGCATTT 43
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 347110 GCTCACCCTCGGATCAGGGGATACCTTAAGTCAGCAGCTTCCTTTGAAGATAGGGCATTT 347169

Query: 42     ACATAAACTCCGAAACCGTACCCAGGGAGCTTACATCAGGAA 1
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 347170 ACATAAACTCCGAAACCGTACCCAGGGAGCTTACATCAGGAA 347216


  Database: /home/vicky/BKPVICKY/BLASTdb/tabaco.fasta
  Number of letters in database: 430597
  Number of sequences in database:  1

Lambda     K      H
    1.37    0.711     1.31

Matrix: BLASTN matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 1
Length of database: 430597